活性炭吸附技術：作為一種炭質的多孔吸附材料，活性炭的表面具有巨大的孔隙結構，且由于孔隙結構的高度發達具有很強的吸附能力。能夠有效減少廢水中的色度、臭味、消毒副產物、重金屬等。利用三級活性炭過濾處理制藥廠的二級生化出水實驗進行研究，能夠得知經過過濾后的出水化學需氧量在40mg/L的質量濃度之下。但是，關于活性炭的處理成本問題，在當前的應用發展中有一定限制。

　　膜分離技術主要出現在二十世紀六十年代后得到迅速發展，并同時具有精致、濃縮、分離等特質，操作過程較為簡單，能夠通過分子的環保節能操作，使其更容易被控制。當前的膜分離技術，在廢水處理的過程中主要通過反滲透、微濾等作用將細菌雜質等懸浮物進行沉淀去除。并對其中的礦化度減弱，進而減少總溶解固體。

當前的制藥廢水處理即使經過二次處理也無法達到新的排放標準，但考慮到當前的預處理中廢水的出水可化性較強，所以還應首先考慮生物處理方式，并且這種方式在廢水處理中效果更明顯，處理成本也較小，具有穩定的處理效果。這些優勢都是其余處理技術無法比較的。因為好氧的生化處理能夠對中低度廢水處理更加明顯，所以在深度的廢水處理工藝中，應使用預處理、好氧深度處理的結合技術是比較適合的。當前的深度研究處理中主要是利用曝氣生物濾池、生物活性炭法、膜生物反應器以及生物接觸氧化法進行。