【儀表網(wǎng) 儀表研發(fā)】單細胞測序技術是一種在單細胞水平上對基因組、轉(zhuǎn)錄組、表觀組等進行高通量測序分析的技術。單細胞測序技術能夠在組學水平揭示細胞間的異質(zhì)性。單細胞水平細胞譜系追蹤技術位居2018年Science 雜志評選的科學突破。常規(guī)單細胞轉(zhuǎn)錄組測序技術丟失了細胞在原組織中至關重要的空間位置信息，而單細胞空間轉(zhuǎn)錄組技術在進行單細胞轉(zhuǎn)錄組測序的同時保留并記錄了細胞的空間位置信息。空間轉(zhuǎn)錄組技術能夠揭示細胞間的相互作用以及細胞所處的微環(huán)境，將成為發(fā)育生物學、神經(jīng)生物學、免疫生物學、腫瘤微環(huán)境等領域的研究利器。
 

　　11月12日，《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在線發(fā)表了中國科學院生物物理研究所高通量測序中心題目為SpatialDB: a database for spatially resolved transcriptomes 的論文，發(fā)布個單細胞空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫及數(shù)據(jù)在線可視化平臺。SpatialDB系統(tǒng)收錄了來自5個物種由8種空間轉(zhuǎn)錄組技術產(chǎn)生的數(shù)據(jù)，建立了空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析處理流程，實現(xiàn)了空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的在線可視化，同時提供了空間差異表達基因及其功能富集分析的注釋。
 

　　中科院院士、生物物理所研究員陳潤生以及工程師陳小偉為論文共同通訊作者。生物物理所高通量測序中心工程師范珍為論文作者。該研究獲得中科院關鍵技術人才項目、國家自然科學基金和國家重點研發(fā)項目的資助。